零二是Code:002，长有红色双角的神秘少女，也是驾驶FRANXX“Strelizia”的精英Parasite。她与普通孩子不同，体内混有叫龙血统，幼年时曾被当作实验对象隔离观察。那时的她皮肤偏红，语言和情感表达都被压抑，只被研究人员视为样本。年幼的Hiro闯入设施后与她相遇，为她读绘本，带她逃离，并给了她“Zero Two”的名字。那段短暂逃亡被成年人夺走，两人的记忆也被处理，但“darling”和想成为人类的愿望留在零二心底。
长大后的零二被称为“搭档杀手”。与她共同驾驶的Stamen往往会在几次出击后身体崩溃，因此她身边流传着危险、妖艳和不祥的传闻。零二本人也不在意这些传言。她随心所欲，不喜欢遵守成年人制定的规矩，常以挑衅和笑容与周围保持距离。她认为Parasite终究只是为了战斗和死亡而存在，所以不需要普通名字，也不必对谁建立稳定关系。直到她再次遇见无法驾驶FRANXX的Hiro，并称他为自己的darling。
APE和9's对零二的态度，让她始终处在被需要又被排斥的位置。她的战斗能力远超普通Parasite，Strelizia也被视为特别机体；可她的角、血液和与叫龙的关联，又让成年人和同龄驾驶员把她看作危险素材。娜娜和哈奇负责管理孩子们，却也只能在制度允许的范围内保护他们。零二因此学会用任性和高傲先一步拒绝他人：只要她把所有搭档都当成消耗品，就不用承认自己也害怕被抛弃。
Hiro与零二共同驾驶Strelizia后，原本失去资格的他重新找回存在感。对零二而言，Hiro一开始像是能让她继续战斗、继续接近“人类”的特殊搭档；对Hiro而言，零二则是把他从无用感中拉出去的人。两人一起对抗叫龙，也不断冲撞第13都市孩子们的秩序。Ichigo和其他同伴害怕零二的危险性，零二也以尖锐态度回应他们的排斥。她越是渴望被Hiro接受，越会在“怪物”与“人类”的边界上痛苦挣扎。
第13小队的生活让零二第一次接触接近普通青春的东西。莓对Hiro的感情、五郎的忍耐、心和满的变化、未来与郁乃各自的不安，都让这个被训练为驾驶员的群体显露出成人制度之外的欲望。零二起初并不尊重这些脆弱，甚至把他们对Hiro的担心视作阻碍；可当她与Hiro的同步被过去和误解撕裂时，正是这些同伴见证了她并非只想吞噬搭档的怪物。她需要的不是被允许上战场，而是被允许以零二这个名字留在某个人身边。
随着记忆复苏，Hiro与零二发现他们幼年时早已相遇。零二想成为人类，不只是为了摆脱叫龙血统，也是为了兑现绘本中与darling同行的愿望。她曾以为杀死足够多叫龙就能变成人类，却逐渐明白成年人给出的目标只是利用她的谎言。Hiro选择理解她的过去和痛苦，两人终于不再只是驾驶舱里的搭档，而是共同对抗命运的人。Strelizia在他们同步时展现出远超常规的力量，也成为连接人类、叫龙与VIRM战争的关键。
叫龙公主的出现揭开了零二血统的另一端。她并不是人类社会制造出来的普通兵器，而是被夹在人类、叫龙和VIRM漫长战争之间的存在。APE把孩子们当作延续殖民都市的工具，VIRM则以更宏大的名义否定肉体和个体意志。零二对“成为人类”的执念因此发生变化：她不再只是想洗掉角和血统，而是想与Hiro一起选择自己的生命形式。哪怕那条路通向宇宙、牺牲和无法回到地球的未来，也比被他人命名为怪物更接近她要的答案。
故事终局中，零二的意识与Strelizia、叫龙公主和VIRM的宇宙战场相连。她与Hiro选择离开地球，投入超越个人生死的战斗。两人的肉体逐渐无法回到同伴身边，却在遥远宇宙中继续并肩。多年后，他们的灵魂以新的孩子姿态在地球重逢，樱树下的相遇像是那本绘本终于翻到另一页。零二的一生被“怪物”之名束缚，却始终追求成为能爱、能被爱、能与darling一起活下去的人。