立花泷是住在东京市中心的男高中生。平日里，他与朋友们上学、打工、闲逛，在意大利餐厅做服务生，也暗自憧憬同事奥寺前辈。泷喜欢建筑和美术，常在笔记本上画下城市结构与风景。他的生活原本属于东京少年熟悉的节奏：电车、课堂、高楼、兼职、朋友间的玩笑。直到某一天，他醒来时发现自己成了住在飞驒小镇糸守的女高中生宫水三叶。
与三叶交换身体的日子，把泷推入完全陌生的人生。他必须扮演三叶，面对神社、祖母、妹妹、乡下学校和三叶复杂的日常；三叶也在他的身体里改变东京生活。两人最初用手机日记和规则互相抱怨，渐渐却在对方的世界里留下痕迹。泷替三叶拉近与同学的距离，三叶则帮泷与奥寺前辈约会。身体交换像一场荒唐误会，却让两人比普通相遇更深地进入彼此生活。
交换突然停止后，泷发现自己对三叶的记忆正在消失，却仍被无法解释的情感牵引。他凭画出的风景和残缺线索寻找糸守，才知道三年前彗星坠落已毁掉小镇，三叶本应在灾难中死亡。泷没有把这当作梦的终点，而是继续追寻连接两人的方法。在御神体前，他喝下口嚼酒，与三叶跨越时间再次相逢。黄昏之时，两人短暂共处，试图把名字写在彼此手上，也试图改写一座小镇的命运。
他并不是天生英雄，却在记忆逐渐散去时仍选择奔跑；他不完全明白三叶的痛苦，却愿意相信那份牵引真实存在。成年后，泷继续在东京生活，寻找工作，走过无数街道，心中始终有一个忘记名字却忘不掉的缺口。直到雪后阶梯上与三叶擦肩回望，他终于问出“你的名字是”。那一刻，泷多年寻找的并不只是恋人，也是被时间夺走却始终存在的另一半人生。
泷的温柔常藏在行动里。交换身体时，他会替三叶反击同学的议论，也会不自觉改变她与周围人的距离；得知糸守灾难后，他把素描、地名和记忆碎片拼成路线，哪怕所有证据都像梦一样不可靠。泷相信的不是超自然解释，而是自己心中那份无法消去的焦急。正是这种不肯放手，让三年前的死亡结局出现改写余地。