琴石奈留是五岛列岛小岛上的小学一年级学生，岛上分校的孩子之一。她个子小，精力却像海风一样停不下来，常穿着轻便衣服在田埂、海边和空屋之间奔跑。奈留不怕生，见到从东京来的年轻书法家半田清舟，也不会因为对方是大人就拘谨。她把半田暂住的空屋当成自己的秘密基地，被发现后仍理直气壮地出入，渐渐把那里变成孩子们和半田都无法缺少的日常据点。
半田清舟来到岛上时，正因在书道界受挫而封闭自己。他习惯城市规则、奖项评价和独自练字，对岛上的人情往来极不适应。奈留的出现像一场无预告的台风。她会爬进屋里，围着半田转，带他认识岛上的海、山、虫子、方言、祭典和邻里关系；也会在他烦恼作品时，用小孩子直白的话戳中问题核心。奈留并不懂书法的权威体系，却能看见半田字里有没有真正的心。
奈留与祖父相依生活，岛上的大人们也都像大家庭一样照看她。她天真顽皮，常和山村美和、新井珠子、久保田阳菜一起行动，把半田拖进各种小事件。她会模仿“大人说的话”，快速吸收片假名、汉字和城里来的表达方式，也会因为好奇惹出麻烦。可她并不是单纯制造混乱的孩子。奈留的开朗背后有对人的敏锐依恋，她很快就把半田当作重要的“先生”，用孩子能做到的全部方式留住他。
对半田而言，奈留像岛本身的化身。她不讲大道理，却用生活让他明白，字不是只写给评审看的，也不是只为了证明自己比别人高明。帮忙参加祭典、和孩子玩耍、听岛民闲聊、被迫处理各种意外，这些看似浪费时间的经历，反而让半田重新找到书道里的呼吸。奈留也在半田身边成长，学会新的字词，看见岛外来的大人原来也会迷路、会闹别扭、会被一句简单的鼓励救回来。
她不是导师，却常给出最像答案的话；她不是家人，却让半田的空屋变得像家。奈留的世界很小，小到一座岛、一所分校、几个玩伴和一个“先生”；可正因为这个世界足够真，她能把困在名声与挫败里的半田拉回生活。她的笑声、奔跑和闯入，正是《元气囝仔》中最朴素的元气。