北原伊织离开男校生活，来到伊豆大学就读，并寄住在叔父经营的潜水商店Grand Blue楼上。他原本期待的是海边、阳光、可爱的表亲和崭新的大学青春；迎接他的却是一群在店里喝酒、脱衣、玩猜拳的潜水社团Peek a Boo前辈。伊织怕水、不会游泳，甚至在第一天就被卷入荒唐场面，以近乎灾难的方式开始了大学生活。
伊织表面上轻浮、爱面子、容易被酒局和损友带偏，脑内经常冒出莫名其妙的歪理。与今村耕平组成搭档后，两人既是朋友也是互相坑害的共犯，从联谊、考试到各种校园事件都能把局面搅到不可收拾。可是他并不是只会胡闹的人。面对吉原爱菜被网球社欺负，他会和耕平一起出头；面对同伴真正低落或受伤，他也常在最不靠谱的外表下拿出直接而诚恳的一面。
Grand Blue与Peek a Boo对伊织而言，起初像误入的魔窟，后来却变成归处。时田和寿这些前辈虽然粗野得离谱，却真心热爱潜水，也懂得海的危险。古手川千纱对潜水的专注，让伊织第一次认真看见海面下的世界；奈奈华、梓、爱菜等人则让他在混乱人际中学会一点点承担。伊织会逃课、会裸奔、会因为愚蠢赌局付出代价，但当同伴需要配合时，他常能用惊人的身体能力和临场反应把事情撑住。
他与千纱的关系尤其复杂。两人是表亲、同学，也是常被误会成情侣的对象。千纱冷静而热爱潜水，伊织则像把麻烦随身携带的风暴；可正因为他的直率和不按常理出牌，千纱身边的封闭空气也会被打乱。伊织并不擅长说漂亮话，他的体贴常混在吐槽、斗嘴和失败的计划里，却因此显得格外真。
北原伊织的青春，是被酒杯、海水、误会和友情揉成一团的混乱日常。他梦想中的大学生活早就偏离轨道，却在潜水训练、社团旅行和一次次荒唐事故中得到另一种颜色。即使他仍然会以最糟糕的方式登场，海面下的景色和伙伴们的大笑，已经让他无法再把Grand Blue只当成临时住处。那里既是灾难的起点，也是他学会喜欢大海、珍惜同伴的地方，热闹得无可替代。