旗木卡卡西是木叶隐村上忍，白发、遮住下半张脸的面罩和左眼写轮眼让他在各国忍者中以“拷贝忍者卡卡西”闻名。他平时语气懒散，经常迟到，手里还拿着《亲热天堂》系列读物，像是对任何事都不上心；但在任务中，他冷静、精确、对学生保护欲极强，也比任何人都清楚忍者世界的规则会怎样夺走同伴。
卡卡西是木叶白牙旗木朔茂之子，从小展现出惊人才能，很早毕业并升为中忍、上忍。父亲曾为了救同伴而放弃任务，却因此遭村中非议，最终自尽。年幼的卡卡西把这件事深埋心底，变得极端重视规则与任务结果。第三次忍界大战中，他隶属波风水门班，与宇智波带土、野原琳并肩作战。神无毗桥任务里，卡卡西和带土因是否救琳产生冲突；随后带土被巨石压住，把刚开眼的写轮眼托付给卡卡西，并留下“破坏规则的人是废物，但不珍惜同伴的人连废物都不如”的信念。
失去带土后，卡卡西又在阴谋中亲手以千鸟贯穿琳。琳为了阻止自己体内的三尾被敌人利用，主动撞向他的术，卡卡西却只能背负“杀死同伴”的记忆活下去。水门后来成为四代火影，却也在九尾之乱中牺牲。接连的失去让卡卡西进入暗部，以冰冷任务压抑创伤。直到后来离开暗部，他才逐渐转向培养后辈，并把带土留下的话变成判断学生是否合格的标准。
第七班成立时，卡卡西负责指导漩涡鸣人、宇智波佐助和春野樱。他用抢铃铛演习考验三人，真正要看的不是个人能力，而是他们能否违背表面规则去保护同伴。波之国任务中，他与桃地再不斩交战，展示写轮眼复制忍术、预判动作和雷切的实力，也让学生们第一次理解忍者战斗的残酷。中忍考试后，他重点指导佐助使用千鸟，同时也尽力在鸣人与佐助逐渐扩大的裂痕中维持第七班。
卡卡西对三个学生的看法并不相同。鸣人的鲁莽和孤独让他想起带土的直线式热情，佐助的天赋、写轮眼和复仇心则不断触及他最不愿重演的过去，小樱最初缺少实战力量，却拥有精细的查克拉控制和观察力。卡卡西无法把他们训练成同一种忍者，只能在任务中让他们理解彼此的空缺。佐助离村前，他用自己的失去劝佐助不要把复仇放在同伴之前，却没能阻止弟子走向大蛇丸；这次失败也成为卡卡西作为老师最深的遗憾之一。
疾风传时期，卡卡西继续作为木叶主力参与对抗晓。他与第十班追击飞段、角都，在佩恩袭击木叶时为保护丁次等人战死，又因长门的轮回天生复活。第四次忍界大战中，他担任联军部队指挥者之一，并最终确认面具男正是当年以为死去的带土。面对已经走向世界毁灭道路的旧友，卡卡西既无法否认自己的愧疚，也没有放弃阻止他。两人在神威空间中的对决，是卡卡西与过去最痛苦的重逢。
第七班在战争中重新站到一起时，卡卡西已经不再只是带队上忍。鸣人学会与九尾并肩作战，佐助带着自己的答案回到战场，小樱继承纲手的力量，三人都走到了他必须仰望其成长的高度。卡卡西在辉夜战中更多承担连接与判断的角色：他理解带土的悔恨，也理解学生们必须超越上一代失败。带土临别前把最后的力量托付给他，让卡卡西短暂拥有双眼神威，这既是战斗助力，也是迟来的告别。
大战终局，卡卡西一度失去写轮眼，却在带土临别赠予的查克拉帮助下短暂获得双万花筒写轮眼，使用完全体须佐能乎支援第七班封印大筒木辉夜。战后，他成为第六代火影，在战乱后的木叶承担重建与过渡责任；等鸣人成长为能够支撑村子的火影后，卡卡西退下位置，继续以老师和前辈身份守望新一代。旗木卡卡西的一生被规则、同伴和悔恨反复撕扯，他最终选择把失去的人留下的信念传给学生，让第七班走出比自己更远的道路。