绫波零是NERV选出的第一适格者，EVA零号机专属驾驶员。她有浅蓝色短发和红色眼睛，平时沉默寡言，几乎不主动表达情绪。第3新东京市立第壹中学校的同学很少能接近她，真嗣初见她时，她身上还带着零号机启动实验事故留下的伤。她的房间空旷冷清，生活物品少得近乎不像少女的住处。对NERV而言，绫波是可以投入战斗的驾驶员；对碇源堂而言，她又是计划中无法替代的钥匙。她服从命令，独自生活，像没有私人愿望的人偶一样存在。
绫波与碇真嗣的接触逐渐改变了她。起初，她只把源堂视为特别的人，因为源堂曾在事故中救出她，也因为她的存在深处与碇唯和莉莉丝相连。真嗣不理解她为何能如此顺从，也不理解她为何愿意为EVA而死；他进入她的房间、看到源堂留下的眼镜和药品时，也第一次意识到这个安静的同班同学与父亲之间有自己无法进入的联系。零号机、初号机和使徒的战斗让两人的关系慢慢发生变化。绫波在对抗第五使徒雷天使时与真嗣共同作战，真嗣拼命救出她，第一次让她露出笨拙的微笑。那一刻之后，她开始感知到自己也许不只是源堂计划的一部分，也开始用很迟缓的方式理解感谢、关心和寂寞。
绫波的秘密藏在NERV地下深处。她并非普通人类少女，而是以碇唯的遗传信息和莉莉丝的灵魂为核心制造出的存在，许多个备用身体被安置在水槽中，并与Dummy Plug系统相关联。更早的绫波个体曾以幼小姿态出现在NERV相关设施中，后来又以“第二个绫波”作为驾驶员存在于真嗣身边。不同个体之间有相似的外形和部分连续性，却并不能简单等同于普通人的成长。她的身体可以被替换，这一事实本身不断削弱她对“唯一的我”的感知。
当绫波在与第十六使徒阿米沙尔的战斗中为了保护真嗣自爆后，新的绫波个体醒来，记忆和情感却并不完整连续。她看到自己的替代身体，也看见赤木律子摧毁水槽时暴露出的残酷真相，逐渐意识到“我是谁”这个问题不能再由源堂或NERV替她回答。她对真嗣的关心、对源堂命令的迟疑、对自身可替换性的厌恶，都让她从工具的位置上偏离。
旧剧场版中，源堂试图利用绫波启动补完计划，把她带向莉莉丝和亚当的融合。绫波却在关键时刻拒绝源堂，选择把主动权交给真嗣。她的身体与莉莉丝合一，成为人类补完仪式的核心形象，也让所有人的心之壁开始崩解。绫波零的故事始于沉默和服从，却并不止于空白。她在与真嗣、源堂、EVA和自己的复制身体相遇中逐步学会选择：不只是被制造出的容器，也不是任何人的替代品，而是在终局前把世界命运从源堂手中夺回的第一适格者，并把选择留给仍活着的人。